Showing metabocard for Pseudophomin B (MMDBc0009611)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-05-15 02:04:39 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-31 06:30:31 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | MMDBc0009611 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Pseudophomin B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Pseudophomin B belongs to the class of organic compounds known as cyclic depsipeptides. These are natural or synthetic compounds having sequences of amino and hydroxy carboxylic acid residues (usually α-amino and α-hydroxy acids) connected in a ring. The residues are commonly but not necessarily regularly alternating. Based on a literature review very few articles have been published on Pseudophomin B. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Formula | C57H101N9O16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Mass | 1168.482 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 1167.736628208 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (4R)-4-{[(3S,6R,9S,12R,15R,18R,21R,22R)-3,18-bis[(2S)-butan-2-yl]-5,8,11,14,17,20-hexahydroxy-6,12-bis(hydroxymethyl)-22-methyl-9,15-bis(2-methylpropyl)-2-oxo-1-oxa-4,7,10,13,16,19-hexaazacyclodocosa-4,7,10,13,16,19-hexaen-21-yl]-C-hydroxycarbonimidoyl}-4-{[(2S)-2-{[(3R)-1,3-dihydroxydodecylidene]amino}-1-hydroxy-4-methylpentylidene]amino}butanoic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (4R)-4-{[(3S,6R,9S,12R,15R,18R,21R,22R)-3,18-bis[(2S)-butan-2-yl]-5,8,11,14,17,20-hexahydroxy-6,12-bis(hydroxymethyl)-22-methyl-9,15-bis(2-methylpropyl)-2-oxo-1-oxa-4,7,10,13,16,19-hexaazacyclodocosa-4,7,10,13,16,19-hexaen-21-yl]-C-hydroxycarbonimidoyl}-4-{[(2S)-2-{[(3R)-1,3-dihydroxydodecylidene]amino}-1-hydroxy-4-methylpentylidene]amino}butanoic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@@](O)(CCCCCCCCC)CC(O)=N[C@@]([H])(CC(C)C)C(O)=N[C@]([H])(CCC(O)=O)C(O)=N[C@@]1([H])C(O)=N[C@@]([H])(C(O)=N[C@]([H])(CC(C)C)C(O)=N[C@]([H])(CO)C(O)=N[C@@]([H])(CC(C)C)C(O)=N[C@]([H])(CO)C(O)=N[C@]([H])(C(=O)O[C@]1([H])C)[C@@]([H])(C)CC)[C@@]([H])(C)CC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C57H101N9O16/c1-13-16-17-18-19-20-21-22-37(69)28-44(70)58-39(25-31(4)5)50(74)59-38(23-24-45(71)72)49(73)66-48-36(12)82-57(81)47(35(11)15-3)65-54(78)43(30-68)63-51(75)40(26-32(6)7)60-53(77)42(29-67)62-52(76)41(27-33(8)9)61-55(79)46(34(10)14-2)64-56(48)80/h31-43,46-48,67-69H,13-30H2,1-12H3,(H,58,70)(H,59,74)(H,60,77)(H,61,79)(H,62,76)(H,63,75)(H,64,80)(H,65,78)(H,66,73)(H,71,72)/t34-,35-,36+,37+,38+,39-,40-,41+,42+,43+,46+,47-,48+/m0/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | QLBHHKHBJWIIDN-VSZHWASFSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as cyclic depsipeptides. These are natural or synthetic compounds having sequences of amino and hydroxy carboxylic acid residues (usually α-amino and α-hydroxy acids) connected in a ring. The residues are commonly but not necessarily regularly alternating. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Peptidomimetics | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Depsipeptides | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Cyclic depsipeptides | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 78440228 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 139585631 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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