Showing metabocard for (+)-viridicatumtoxin B (MMDBc0015944)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2021-05-15 06:41:29 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-08-31 06:40:07 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite ID | MMDBc0015944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | (+)-viridicatumtoxin B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | (+)-viridicatumtoxin B belongs to the class of organic compounds known as tetracyclines. These are polyketides having an octahydrotetracene-2-carboxamide skeleton, substituted with many hydroxy and other groups (+)-viridicatumtoxin B is a very strong basic compound (based on its pKa). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  MOL for #<Metabolite:0x00007fb809352c08>
Mrv1652305152108412D
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> <DATABASE_ID>
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PDB for #<Metabolite:0x00007fb809352c08>HEADER PROTEIN 15-MAY-21 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 15-MAY-21 0 HETATM 1 C UNK 0 1.429 0.918 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 2 C UNK 0 -2.564 4.795 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 -0.270 5.170 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 C UNK 0 -3.340 6.705 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 5 C UNK 0 -2.576 1.669 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 6 C UNK 0 -1.238 0.905 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 7 C UNK 0 -2.583 3.209 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 8 C UNK 0 -0.330 7.360 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 9 C UNK 0 1.494 2.602 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 10 C UNK 0 7.152 1.108 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 11 C UNK 0 0.092 1.682 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 12 C UNK 0 2.519 3.752 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 13 C UNK 0 1.174 7.688 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 14 C UNK 0 8.692 1.115 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 15 C UNK 0 -0.799 5.893 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 16 C UNK 0 1.742 5.082 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 17 C UNK 0 4.059 3.760 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 18 C UNK 0 2.505 6.419 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 19 C UNK 0 9.455 2.453 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 20 C UNK 0 4.822 5.097 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 21 C UNK 0 0.237 4.754 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 22 C UNK 0 4.045 6.427 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 23 C UNK 0 4.835 2.430 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 24 C UNK 0 8.679 3.783 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 25 C UNK 0 6.362 5.105 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 26 C UNK 0 10.995 2.461 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 27 C UNK 0 -1.254 3.985 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 28 C UNK 0 0.084 3.222 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 29 C UNK 0 6.375 2.438 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 30 C UNK 0 7.139 3.775 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 31 N UNK 0 11.759 3.798 0.000 0.00 0.00 N+0 HETATM 32 O UNK 0 1.590 9.171 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 33 O UNK 0 9.468 -0.214 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 34 O UNK 0 4.809 7.765 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 35 O UNK 0 4.072 1.092 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 36 O UNK 0 9.442 5.120 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 37 O UNK 0 7.125 6.442 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 38 O UNK 0 11.772 1.131 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 39 O UNK 0 5.612 1.100 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 40 O UNK 0 7.902 5.113 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 41 O UNK 0 -2.304 5.566 0.000 0.00 0.00 O+0 CONECT 1 11 CONECT 2 27 CONECT 3 27 CONECT 4 41 CONECT 5 6 7 CONECT 6 5 11 CONECT 7 5 27 CONECT 8 13 15 CONECT 9 12 28 CONECT 10 14 29 CONECT 11 1 6 28 CONECT 12 9 16 17 CONECT 13 8 18 32 CONECT 14 10 19 33 CONECT 15 8 21 41 CONECT 16 12 18 21 CONECT 17 12 20 23 CONECT 18 13 16 22 CONECT 19 14 24 26 CONECT 20 17 22 25 CONECT 21 15 16 28 CONECT 22 18 20 34 CONECT 23 17 29 35 CONECT 24 19 30 36 CONECT 25 20 30 37 CONECT 26 19 31 38 CONECT 27 2 3 7 28 CONECT 28 9 11 21 27 CONECT 29 10 23 30 39 CONECT 30 24 25 29 40 CONECT 31 26 CONECT 32 13 CONECT 33 14 CONECT 34 22 CONECT 35 23 CONECT 36 24 CONECT 37 25 CONECT 38 26 CONECT 39 29 CONECT 40 30 CONECT 41 4 15 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 41 0 92 0 END SMILES for #<Metabolite:0x00007fb809352c08>COC1=C2C3=C(C[C@]22C(C)=CCCC2(C)C)C2=C(C(O)=C3C(O)=C1)C(=O)[C@]1(O)C(O)=C(C(O)=N)C(=O)C[C@]1(O)C2=O INCHI for #<Metabolite:0x00007fb809352c08>InChI=1S/C30H29NO10/c1-11-6-5-7-27(2,3)28(11)9-12-16-18(13(32)8-15(41-4)21(16)28)22(34)20-17(12)23(35)29(39)10-14(33)19(26(31)38)24(36)30(29,40)25(20)37/h6,8,32,34,36,39-40H,5,7,9-10H2,1-4H3,(H2,31,38)/t28-,29-,30+/m0/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fb809352c08> | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Formula | C30H29NO10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Mass | 563.559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 563.179146138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (1S,4'R,9'S)-4',8',9',12',14'-pentahydroxy-16'-methoxy-2,6,6-trimethyl-3',6',10'-trioxospiro[cyclohexane-1,18'-pentacyclo[11.6.1.0^{2,11}.0^{4,9}.0^{17,20}]icosane]-1'(20'),2,2'(11'),7',12',14',16'-heptaene-7'-carboximidic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | (1S,4'R,9'S)-4',8',9',12',14'-pentahydroxy-16'-methoxy-2,6,6-trimethyl-3',6',10'-trioxospiro[cyclohexane-1,18'-pentacyclo[11.6.1.0^{2,11}.0^{4,9}.0^{17,20}]icosane]-1'(20'),2,2'(11'),7',12',14',16'-heptaene-7'-carboximidic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | COC1=C2C3=C(C[C@]22C(C)=CCCC2(C)C)C2=C(C(O)=C3C(O)=C1)C(=O)[C@]1(O)C(O)=C(C(O)=N)C(=O)C[C@]1(O)C2=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C30H29NO10/c1-11-6-5-7-27(2,3)28(11)9-12-16-18(13(32)8-15(41-4)21(16)28)22(34)20-17(12)23(35)29(39)10-14(33)19(26(31)38)24(36)30(29,40)25(20)37/h6,8,32,34,36,39-40H,5,7,9-10H2,1-4H3,(H2,31,38)/t28-,29-,30+/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | WUFPHUQCGWRGKE-OIFRRMEBSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as tetracyclines. These are polyketides having an octahydrotetracene-2-carboxamide skeleton, substituted with many hydroxy and other groups. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Phenylpropanoids and polyketides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Tetracyclines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Tetracyclines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aromatic homopolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Expected Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Proteins and Enzymes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Human Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Metabolic Reactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Health Effects and Bioactivity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Microbial Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Exposure Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Host Biospecimen and Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 78441369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 72204240 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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