Showing metabocard for (3E)-2-oxohex-3-enedioate (MMDBc0050323)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-05-16 19:54:46 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-09-01 02:17:54 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite ID | MMDBc0050323 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | (3E)-2-oxohex-3-enedioate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | (3E)-2-oxohex-3-enedioate belongs to the class of organic compounds known as medium-chain keto acids and derivatives. These are keto acids with a 6 to 12 carbon atoms long side chain. Based on a literature review very few articles have been published on (3E)-2-oxohex-3-enedioate. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  MOL for #<Metabolite:0x00007f83395da1d8>
Mrv1652303261905182D
13 12 0 0 0 0 999 V2000
1.2375 -0.7145 0.0000 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.8250 0.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.2375 0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.0625 0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.4750 1.4289 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.4750 0.0000 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.0000 0.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.4125 0.7145 0.0000 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.4125 -0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.0000 -1.4289 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.2375 -0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.6500 -1.4289 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.6500 0.0000 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1 2 1 0 0 0 0
2 3 1 0 0 0 0
3 4 1 0 0 0 0
4 5 1 0 0 0 0
4 6 2 0 0 0 0
2 7 2 0 0 0 0
7 8 1 0 0 0 0
7 9 1 0 0 0 0
9 10 2 0 0 0 0
9 11 1 0 0 0 0
11 12 1 0 0 0 0
11 13 2 0 0 0 0
M CHG 2 5 -1 12 -1
M END
3D SDF for #<Metabolite:0x00007f83395da1d8>
Mrv1652303261905182D
13 12 0 0 0 0 999 V2000
1.2375 -0.7145 0.0000 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.8250 0.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.2375 0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.0625 0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.4750 1.4289 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.4750 0.0000 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.0000 0.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.4125 0.7145 0.0000 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.4125 -0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.0000 -1.4289 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.2375 -0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.6500 -1.4289 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.6500 0.0000 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1 2 1 0 0 0 0
2 3 1 0 0 0 0
3 4 1 0 0 0 0
4 5 1 0 0 0 0
4 6 2 0 0 0 0
2 7 2 0 0 0 0
7 8 1 0 0 0 0
7 9 1 0 0 0 0
9 10 2 0 0 0 0
9 11 1 0 0 0 0
11 12 1 0 0 0 0
11 13 2 0 0 0 0
M CHG 2 5 -1 12 -1
M END
> <DATABASE_ID>
MMDBc0050323
> <DATABASE_NAME>
MIME
> <SMILES>
[H]\C(CC([O-])=O)=C(\[H])C(=O)C([O-])=O
> <INCHI_IDENTIFIER>
InChI=1S/C6H6O5/c7-4(6(10)11)2-1-3-5(8)9/h1-2H,3H2,(H,8,9)(H,10,11)/p-2/b2-1+
> <INCHI_KEY>
QTHJXLFFFTVYJC-OWOJBTEDSA-L
> <FORMULA>
C6H4O5
> <MOLECULAR_WEIGHT>
156.094
> <EXACT_MASS>
156.006970389
> <JCHEM_ACCEPTOR_COUNT>
5
> <JCHEM_ATOM_COUNT>
15
> <JCHEM_AVERAGE_POLARIZABILITY>
12.820920908668409
> <JCHEM_BIOAVAILABILITY>
1
> <JCHEM_DONOR_COUNT>
0
> <JCHEM_FORMAL_CHARGE>
-2
> <JCHEM_GHOSE_FILTER>
0
> <JCHEM_IUPAC>
(3E)-2-oxohex-3-enedioate
> <ALOGPS_LOGP>
-0.01
> <JCHEM_LOGP>
0.33312885500000006
> <ALOGPS_LOGS>
-1.12
> <JCHEM_MDDR_LIKE_RULE>
0
> <JCHEM_NUMBER_OF_RINGS>
0
> <JCHEM_PHYSIOLOGICAL_CHARGE>
-2
> <JCHEM_PKA>
3.9002532138811494
> <JCHEM_PKA_STRONGEST_ACIDIC>
2.7085954598165105
> <JCHEM_POLAR_SURFACE_AREA>
97.32999999999998
> <JCHEM_REFRACTIVITY>
56.251500000000014
> <JCHEM_ROTATABLE_BOND_COUNT>
4
> <JCHEM_RULE_OF_FIVE>
1
> <ALOGPS_SOLUBILITY>
1.46e+01 g/l
> <JCHEM_TRADITIONAL_IUPAC>
(3E)-2-oxohex-3-enedioate
> <JCHEM_VEBER_RULE>
0
$$$$
PDB for #<Metabolite:0x00007f83395da1d8>HEADER PROTEIN 26-MAR-19 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 26-MAR-19 0 HETATM 1 H UNK 0 2.310 -1.334 0.000 0.00 0.00 H+0 HETATM 2 C UNK 0 1.540 0.000 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 2.310 1.334 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 C UNK 0 3.850 1.334 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 5 O UNK 0 4.620 2.667 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 6 O UNK 0 4.620 0.000 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 7 C UNK 0 0.000 0.000 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 8 H UNK 0 -0.770 1.334 0.000 0.00 0.00 H+0 HETATM 9 C UNK 0 -0.770 -1.334 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 10 O UNK 0 0.000 -2.667 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 11 C UNK 0 -2.310 -1.334 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 12 O UNK 0 -3.080 -2.667 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 13 O UNK 0 -3.080 0.000 0.000 0.00 0.00 O+0 CONECT 1 2 CONECT 2 1 3 7 CONECT 3 2 4 CONECT 4 3 5 6 CONECT 5 4 CONECT 6 4 CONECT 7 2 8 9 CONECT 8 7 CONECT 9 7 10 11 CONECT 10 9 CONECT 11 9 12 13 CONECT 12 11 CONECT 13 11 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 24 0 END INCHI for #<Metabolite:0x00007f83395da1d8>InChI=1S/C6H6O5/c7-4(6(10)11)2-1-3-5(8)9/h1-2H,3H2,(H,8,9)(H,10,11)/p-2/b2-1+ 3D Structure for #<Metabolite:0x00007f83395da1d8> | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Formula | C6H4O5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Mass | 156.094 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 156.006970389 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (3E)-2-oxohex-3-enedioate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | (3E)-2-oxohex-3-enedioate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H]\C(CC([O-])=O)=C(\[H])C(=O)C([O-])=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C6H6O5/c7-4(6(10)11)2-1-3-5(8)9/h1-2H,3H2,(H,8,9)(H,10,11)/p-2/b2-1+ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | QTHJXLFFFTVYJC-OWOJBTEDSA-L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as medium-chain keto acids and derivatives. These are keto acids with a 6 to 12 carbon atoms long side chain. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Keto acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Medium-chain keto acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Medium-chain keto acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 28184720 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | CPD-8742 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 25245156 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 64908 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
