Showing metabocard for UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-alpha-D-xylo-hex-4-ulose (MMDBc0054685)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-06-05 23:24:15 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-12 20:09:03 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | MMDBc0054685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-alpha-D-xylo-hex-4-ulose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-alpha-D-xylo-hex-4-ulose belongs to the class of organic compounds known as pyrimidine nucleotide sugars. These are pyrimidine nucleotides bound to a saccharide derivative through the terminal phosphate group. UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-alpha-D-xylo-hex-4-ulose is an extremely weak basic (essentially neutral) compound (based on its pKa). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | MOL for #<Metabolite:0x0000562303f3dc08>Mrv0541 05041412332D 46 48 0 0 1 0 999 V2000 4.9024 9.2852 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.0084 12.8523 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -2.4757 3.8205 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.9908 4.4879 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0231 6.9486 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4.2893 9.8372 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.6215 12.3003 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.7615 6.6937 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -3.2962 3.9067 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.0631 10.9413 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4.4608 10.6442 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.4289 7.1786 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.8477 11.1962 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -2.0964 6.6937 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.8414 5.9090 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.8916 10.1343 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -3.1468 5.3278 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.4500 11.4933 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -3.6318 4.6604 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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35 36 CONECT 39 6 CONECT 40 8 CONECT 41 10 CONECT 42 12 CONECT 43 13 CONECT 44 14 CONECT 45 15 CONECT 46 16 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 46 0 96 0 END SMILES for #<Metabolite:0x0000562303f3dc08>[H][C@]1(COP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@@]2([H])O[C@]([H])(C)C(=O)[C@]([H])(O)[C@@]2([H])N=C(C)O)O[C@@]([H])(N2C=CC(O)=NC2=O)[C@]([H])(O)[C@]1([H])O INCHI for #<Metabolite:0x0000562303f3dc08>InChI=1S/C17H25N3O16P2/c1-6-11(23)13(25)10(18-7(2)21)16(33-6)35-38(30,31)36-37(28,29)32-5-8-12(24)14(26)15(34-8)20-4-3-9(22)19-17(20)27/h3-4,6,8,10,12-16,24-26H,5H2,1-2H3,(H,18,21)(H,28,29)(H,30,31)(H,19,22,27)/t6-,8-,10-,12-,13-,14-,15-,16-/m1/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x0000562303f3dc08> | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Molecular Formula | C17H25N3O16P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Mass | 589.3384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 589.071004791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | N-[(2R,3R,4R,6R)-2-({[({[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(4-hydroxy-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl)oxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)-4-hydroxy-6-methyl-5-oxooxan-3-yl]ethanimidic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | N-[(2R,3R,4R,6R)-2-[({[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(4-hydroxy-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy(hydroxy)phosphoryl}oxy(hydroxy)phosphoryl)oxy]-4-hydroxy-6-methyl-5-oxooxan-3-yl]ethanimidic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@]1(COP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@@]2([H])O[C@]([H])(C)C(=O)[C@]([H])(O)[C@@]2([H])N=C(C)O)O[C@@]([H])(N2C=CC(O)=NC2=O)[C@]([H])(O)[C@]1([H])O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C17H25N3O16P2/c1-6-11(23)13(25)10(18-7(2)21)16(33-6)35-38(30,31)36-37(28,29)32-5-8-12(24)14(26)15(34-8)20-4-3-9(22)19-17(20)27/h3-4,6,8,10,12-16,24-26H,5H2,1-2H3,(H,18,21)(H,28,29)(H,30,31)(H,19,22,27)/t6-,8-,10-,12-,13-,14-,15-,16-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | XBILTLYIKDPORV-HZUXRPHDSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as pyrimidine nucleotide sugars. These are pyrimidine nucleotides bound to a saccharide derivative through the terminal phosphate group. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Nucleosides, nucleotides, and analogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Pyrimidine nucleotides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Pyrimidine nucleotide sugars | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Pyrimidine nucleotide sugars | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Human Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Metabolic Reactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Health Effects and Bioactivity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Microbial Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Exposure Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Host Biospecimen and Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C04613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 46173732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 62420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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