Showing metabocard for (S)-serinol phosphate (MMDBc0055078)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-06-17 19:41:27 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-12 20:09:13 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | MMDBc0055078 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | (S)-serinol phosphate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | (2S)-2-amino-3-(hydrogen phosphonatooxy)propan-1-ol belongs to the class of organic compounds known as phosphoethanolamines. Phosphoethanolamines are compounds containing a phosphate linked to the second carbon of an ethanolamine. Based on a literature review very few articles have been published on (2S)-2-amino-3-(hydrogen phosphonatooxy)propan-1-ol. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | MOL for #<Metabolite:0x00007fd5d0132da8>Mrv1652306172221412D 11 10 0 0 1 0 999 V2000 2.4750 -1.4289 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.2375 -0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.0625 -0.7145 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.4750 -0.0000 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.3000 -1.4289 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.8250 0.0000 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 0.8250 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 -0.8250 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.8250 0.0000 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 P 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.6500 -1.4289 0.0000 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1 1 0 0 0 0 3 2 1 0 0 0 0 3 4 1 6 0 0 0 5 1 1 0 0 0 0 9 2 1 0 0 0 0 10 6 1 0 0 0 0 10 7 1 0 0 0 0 10 8 2 0 0 0 0 10 9 1 0 0 0 0 3 11 1 6 0 0 0 M CHG 1 6 -1 M END 3D SDF for #<Metabolite:0x00007fd5d0132da8>Mrv1652306172221412D 11 10 0 0 1 0 999 V2000 2.4750 -1.4289 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.2375 -0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.0625 -0.7145 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.4750 -0.0000 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.3000 -1.4289 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.8250 0.0000 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 0.8250 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 -0.8250 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.8250 0.0000 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 P 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.6500 -1.4289 0.0000 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1 1 0 0 0 0 3 2 1 0 0 0 0 3 4 1 6 0 0 0 5 1 1 0 0 0 0 9 2 1 0 0 0 0 10 6 1 0 0 0 0 10 7 1 0 0 0 0 10 8 2 0 0 0 0 10 9 1 0 0 0 0 3 11 1 6 0 0 0 M CHG 1 6 -1 M END > <DATABASE_ID> MMDBc0055078 > <DATABASE_NAME> MIME > <SMILES> [H][C@](N)(CO)COP(O)([O-])=O > <INCHI_IDENTIFIER> InChI=1S/C3H10NO5P/c4-3(1-5)2-9-10(6,7)8/h3,5H,1-2,4H2,(H2,6,7,8)/p-1/t3-/m0/s1 > <INCHI_KEY> WDWYJNPKBKWDBL-VKHMYHEASA-M > <FORMULA> C3H9NO5P > <MOLECULAR_WEIGHT> 170.081 > <EXACT_MASS> 170.022382972 > <JCHEM_ACCEPTOR_COUNT> 5 > <JCHEM_ATOM_COUNT> 19 > <JCHEM_AVERAGE_POLARIZABILITY> 13.630102859365653 > <JCHEM_BIOAVAILABILITY> 1 > <JCHEM_DONOR_COUNT> 3 > <JCHEM_FORMAL_CHARGE> -1 > <JCHEM_GHOSE_FILTER> 0 > <JCHEM_IUPAC> (2S)-2-amino-3-(hydrogen phosphonooxy)propan-1-ol > <JCHEM_LOGP> -3.0816271790400642 > <JCHEM_MDDR_LIKE_RULE> 0 > <JCHEM_NUMBER_OF_RINGS> 0 > <JCHEM_PHYSIOLOGICAL_CHARGE> -1 > <JCHEM_PKA> 6.556709423661947 > <JCHEM_PKA_STRONGEST_ACIDIC> 1.5299444913854345 > <JCHEM_PKA_STRONGEST_BASIC> 9.691759774550967 > <JCHEM_POLAR_SURFACE_AREA> 115.84000000000002 > <JCHEM_REFRACTIVITY> 31.9248 > <JCHEM_ROTATABLE_BOND_COUNT> 4 > <JCHEM_RULE_OF_FIVE> 1 > <JCHEM_TRADITIONAL_IUPAC> (2S)-2-amino-3-(hydrogen phosphonooxy)propan-1-ol > <JCHEM_VEBER_RULE> 0 $$$$ PDB for #<Metabolite:0x00007fd5d0132da8>HEADER PROTEIN 17-JUN-22 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 17-JUN-22 0 HETATM 1 C UNK 0 4.620 -2.667 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 2 C UNK 0 2.310 -1.334 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 3.850 -1.334 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 N UNK 0 4.620 -0.000 0.000 0.00 0.00 N+0 HETATM 5 O UNK 0 6.160 -2.667 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 6 O UNK 0 -1.540 0.000 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 7 O UNK 0 0.000 1.540 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 8 O UNK 0 0.000 -1.540 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 9 O UNK 0 1.540 0.000 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 10 P UNK 0 0.000 0.000 0.000 0.00 0.00 P+0 HETATM 11 H UNK 0 3.080 -2.667 0.000 0.00 0.00 H+0 CONECT 1 3 5 CONECT 2 3 9 CONECT 3 1 2 4 11 CONECT 4 3 CONECT 5 1 CONECT 6 10 CONECT 7 10 CONECT 8 10 CONECT 9 2 10 CONECT 10 6 7 8 9 CONECT 11 3 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 20 0 END INCHI for #<Metabolite:0x00007fd5d0132da8>InChI=1S/C3H10NO5P/c4-3(1-5)2-9-10(6,7)8/h3,5H,1-2,4H2,(H2,6,7,8)/p-1/t3-/m0/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fd5d0132da8> | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Formula | C3H9NO5P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Mass | 170.081 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 170.022382972 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2S)-2-amino-3-(hydrogen phosphonooxy)propan-1-ol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (2S)-2-amino-3-(hydrogen phosphonooxy)propan-1-ol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@](N)(CO)COP(O)([O-])=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C3H10NO5P/c4-3(1-5)2-9-10(6,7)8/h3,5H,1-2,4H2,(H2,6,7,8)/p-1/t3-/m0/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | WDWYJNPKBKWDBL-VKHMYHEASA-M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as phosphoethanolamines. Phosphoethanolamines are compounds containing a phosphate linked to the second carbon of an ethanolamine. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Organic phosphoric acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Phosphate esters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Phosphoethanolamines | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 40602794 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 184377 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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