Showing metabocard for 2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate (MMDBc0055215)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-06-17 19:46:33 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-08-12 20:09:17 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite ID | MMDBc0055215 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | 2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | 2-Dehydro-3-deoxy-L-arabinonate belongs to the class of organic compounds known as short-chain keto acids and derivatives. These are keto acids with an alkyl chain the contains less than 6 carbon atoms. Based on a literature review very few articles have been published on 2-Dehydro-3-deoxy-L-arabinonate. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  MOL for #<Metabolite:0x00007fd5cc774170>
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PDB for #<Metabolite:0x00007fd5cc774170>HEADER PROTEIN 17-JUN-22 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 17-JUN-22 0 HETATM 1 C UNK 0 7.287 2.667 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 2 C UNK 0 4.620 2.667 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 5.954 3.437 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 C UNK 0 8.621 3.437 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 5 C UNK 0 9.955 2.667 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 6 O UNK 0 3.286 3.437 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 7 O UNK 0 5.954 4.977 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 8 O UNK 0 8.621 4.977 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 9 O UNK 0 11.288 3.437 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 10 O UNK 0 9.955 1.127 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 11 H UNK 0 5.954 1.897 0.000 0.00 0.00 H+0 CONECT 1 3 4 CONECT 2 3 6 CONECT 3 1 2 7 11 CONECT 4 1 5 8 CONECT 5 4 9 10 CONECT 6 2 CONECT 7 3 CONECT 8 4 CONECT 9 5 CONECT 10 5 CONECT 11 3 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 20 0 END INCHI for #<Metabolite:0x00007fd5cc774170>InChI=1S/C5H8O5/c6-2-3(7)1-4(8)5(9)10/h3,6-7H,1-2H2,(H,9,10)/p-1/t3-/m1/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fd5cc774170> | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Molecular Formula | C5H7O5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Mass | 147.107 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 147.029896905 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (4R)-4,5-dihydroxy-2-oxopentanoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | 2-dehydro-3-deoxy-L-pentonate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H][C@](O)(CO)CC(=O)C([O-])=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C5H8O5/c6-2-3(7)1-4(8)5(9)10/h3,6-7H,1-2H2,(H,9,10)/p-1/t3-/m1/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | UQIGQRSJIKIPKZ-GSVOUGTGSA-M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as short-chain keto acids and derivatives. These are keto acids with an alkyl chain the contains less than 6 carbon atoms. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Keto acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Short-chain keto acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Short-chain keto acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 5256740 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 6857400 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 35173 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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