Showing metabocard for 5-deoxy-D-glucuronic acid (MMDBc0055557)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-06-17 19:58:49 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-08-12 20:09:24 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite ID | MMDBc0055557 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | 5-deoxy-D-glucuronic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | 5-deoxy-D-glucuronate belongs to the class of organic compounds known as sugar acids and derivatives. Sugar acids and derivatives are compounds containing a saccharide unit which bears a carboxylic acid group. Based on a literature review very few articles have been published on 5-deoxy-D-glucuronate. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  MOL for #<Metabolite:0x00007fd5a8ad7e58>
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MIME
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-1
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PDB for #<Metabolite:0x00007fd5a8ad7e58>HEADER PROTEIN 17-JUN-22 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 17-JUN-22 0 HETATM 1 C UNK 0 5.541 0.770 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 2 C UNK 0 0.206 0.770 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 4.207 0.000 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 C UNK 0 1.540 0.000 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 5 C UNK 0 6.875 0.000 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 6 C UNK 0 2.874 0.770 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 7 O UNK 0 -1.127 -0.000 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 8 O UNK 0 4.207 -1.540 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 9 O UNK 0 1.540 -1.540 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 10 O UNK 0 8.208 0.770 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 11 O UNK 0 6.875 -1.540 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 12 O UNK 0 2.874 2.310 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 13 H UNK 0 4.207 1.540 0.000 0.00 0.00 H+0 HETATM 14 H UNK 0 1.540 1.540 0.000 0.00 0.00 H+0 HETATM 15 H UNK 0 2.874 -0.770 0.000 0.00 0.00 H+0 CONECT 1 3 5 CONECT 2 4 7 CONECT 3 1 6 8 13 CONECT 4 2 6 9 14 CONECT 5 1 10 11 CONECT 6 3 4 12 15 CONECT 7 2 CONECT 8 3 CONECT 9 4 CONECT 10 5 CONECT 11 5 CONECT 12 6 CONECT 13 3 CONECT 14 4 CONECT 15 6 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 28 0 END SMILES for #<Metabolite:0x00007fd5a8ad7e58>[H][C@@](O)(CC([O-])=O)[C@]([H])(O)[C@@]([H])(O)C=O INCHI for #<Metabolite:0x00007fd5a8ad7e58>InChI=1S/C6H10O6/c7-2-4(9)6(12)3(8)1-5(10)11/h2-4,6,8-9,12H,1H2,(H,10,11)/p-1/t3-,4+,6+/m1/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fd5a8ad7e58> | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Molecular Formula | C6H9O6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Mass | 177.133 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 177.04046159 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (3R,4S,5R)-3,4,5-trihydroxy-6-oxohexanoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | 5-deoxy-D-glucuronate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H][C@@](O)(CC([O-])=O)[C@]([H])(O)[C@@]([H])(O)C=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C6H10O6/c7-2-4(9)6(12)3(8)1-5(10)11/h2-4,6,8-9,12H,1H2,(H,10,11)/p-1/t3-,4+,6+/m1/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | HPITTXOWHLWIEK-IWGUZYHVSA-M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as sugar acids and derivatives. Sugar acids and derivatives are compounds containing a saccharide unit which bears a carboxylic acid group. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic oxygen compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Organooxygen compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Sugar acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 26331400 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 46878459 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 58852 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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