Showing metabocard for D-ribose 2,5-bisphosphate (MMDBc0055874)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-06-17 20:09:32 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2022-08-12 20:09:28 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite ID | MMDBc0055874 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | D-ribose 2,5-bisphosphate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | D-ribose 2,5-bisphosphate belongs to the class of organic compounds known as pentose phosphates. These are carbohydrate derivatives containing a pentose substituted by one or more phosphate groups. Based on a literature review very few articles have been published on D-ribose 2,5-bisphosphate. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  MOL for #<Metabolite:0x00007fd5d9072ef0>
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> <DATABASE_NAME>
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PDB for #<Metabolite:0x00007fd5d9072ef0>HEADER PROTEIN 17-JUN-22 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 17-JUN-22 0 HETATM 1 C UNK 0 3.770 1.651 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 2 C UNK 0 2.306 1.175 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 1.060 2.080 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 C UNK 0 -0.186 1.175 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 5 C UNK 0 0.290 -0.290 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 6 O UNK 0 1.060 3.620 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 7 O UNK 0 -0.615 -1.536 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 8 O UNK 0 7.844 1.572 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 9 O UNK 0 5.904 2.561 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 10 O UNK 0 6.855 -0.369 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 11 O UNK 0 -3.940 -0.410 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 12 O UNK 0 -3.826 1.765 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 13 O UNK 0 -1.765 -0.524 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 14 O UNK 0 4.915 0.620 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 15 O UNK 0 1.830 -0.290 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 16 O UNK 0 -1.651 1.651 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 17 P UNK 0 6.379 1.096 0.000 0.00 0.00 P+0 HETATM 18 P UNK 0 -2.795 0.620 0.000 0.00 0.00 P+0 HETATM 19 H UNK 0 2.547 2.696 0.000 0.00 0.00 H+0 HETATM 20 H UNK 0 -0.312 2.779 0.000 0.00 0.00 H+0 HETATM 21 H UNK 0 -1.275 0.086 0.000 0.00 0.00 H+0 HETATM 22 H UNK 0 0.989 -1.662 0.000 0.00 0.00 H+0 CONECT 1 2 14 CONECT 2 1 3 15 19 CONECT 3 2 4 6 20 CONECT 4 3 5 16 21 CONECT 5 4 7 15 22 CONECT 6 3 CONECT 7 5 CONECT 8 17 CONECT 9 17 CONECT 10 17 CONECT 11 18 CONECT 12 18 CONECT 13 18 CONECT 14 1 17 CONECT 15 2 5 CONECT 16 4 18 CONECT 17 8 9 10 14 CONECT 18 11 12 13 16 CONECT 19 2 CONECT 20 3 CONECT 21 4 CONECT 22 5 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 22 0 44 0 END SMILES for #<Metabolite:0x00007fd5d9072ef0>[H]C1(O)O[C@]([H])(COP([O-])([O-])=O)[C@@]([H])(O)[C@@]1([H])OP([O-])([O-])=O INCHI for #<Metabolite:0x00007fd5d9072ef0>InChI=1S/C5H12O11P2/c6-3-2(1-14-17(8,9)10)15-5(7)4(3)16-18(11,12)13/h2-7H,1H2,(H2,8,9,10)(H2,11,12,13)/p-4/t2-,3-,4-,5?/m1/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fd5d9072ef0> | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Formula | C5H8O11P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Mass | 306.058 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 305.956379393 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (3R,4R,5R)-2,4-dihydroxy-5-[(phosphonooxy)methyl]oxolan-3-yl phosphate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | (3R,4R,5R)-2,4-dihydroxy-5-[(phosphonooxy)methyl]oxolan-3-yl phosphate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H]C1(O)O[C@]([H])(COP([O-])([O-])=O)[C@@]([H])(O)[C@@]1([H])OP([O-])([O-])=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C5H12O11P2/c6-3-2(1-14-17(8,9)10)15-5(7)4(3)16-18(11,12)13/h2-7H,1H2,(H2,8,9,10)(H2,11,12,13)/p-4/t2-,3-,4-,5?/m1/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | IPSYCGBKVMUNSL-SOOFDHNKSA-J | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as pentose phosphates. These are carbohydrate derivatives containing a pentose substituted by one or more phosphate groups. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic oxygen compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Organooxygen compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Pentose phosphates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 31150544 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | CPD-15894 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 86289534 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 78345 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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