Showing metabocard for LysoPC(18:3(6Z,9Z,12Z)/0:0) (MMDBc0060164)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2023-02-02 23:59:04 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2023-02-02 23:59:04 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite ID | MMDBc0060164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | LysoPC(18:3(6Z,9Z,12Z)/0:0) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | LysoPC(18:3(6Z,9Z,12Z)) belongs to the class of organic compounds known as 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholines. These are glycerophosphocholines in which the glycerol is esterified with a fatty acid at O-1 position, and linked at position 3 to a phosphocholine. LysoPC(18:3(6Z,9Z,12Z)) is an extremely weak basic (essentially neutral) compound (based on its pKa). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  MOL for #<Metabolite:0x00007fd5da271598>
Mrv0541 02251200362D
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3D SDF for #<Metabolite:0x00007fd5da271598>
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> <DATABASE_NAME>
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PDB for #<Metabolite:0x00007fd5da271598>HEADER PROTEIN 25-FEB-12 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 25-FEB-12 0 HETATM 1 C UNK 0 3.799 -0.633 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 2 C UNK 0 4.997 -1.601 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 4.758 -3.122 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 C UNK 0 5.955 -4.090 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 5 C UNK 0 5.716 -5.611 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 6 C UNK 0 6.913 -6.579 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 7 C UNK 0 6.674 -8.101 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 8 C UNK 0 7.872 -9.069 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 9 C UNK 0 9.309 -8.516 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 10 C UNK 0 10.507 -9.484 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 11 C UNK 0 11.944 -8.931 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 12 C UNK 0 12.183 -7.409 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 13 C UNK 0 13.621 -6.856 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 14 C UNK 0 13.860 -5.335 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 15 C UNK 0 12.662 -4.367 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 16 C UNK 0 12.902 -2.845 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 17 C UNK 0 14.339 -2.292 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 18 C UNK 0 15.537 -3.260 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 19 O UNK 0 15.297 -4.781 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 20 O UNK 0 16.974 -2.707 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 21 C UNK 0 18.172 -3.675 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 22 C UNK 0 19.609 -3.122 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 23 O UNK 0 19.848 -1.601 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 24 C UNK 0 20.807 -4.090 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 25 O UNK 0 22.244 -3.537 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 26 P UNK 0 23.441 -4.505 0.000 0.00 0.00 P+0 HETATM 27 O UNK 0 22.473 -5.703 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 28 O UNK 0 24.409 -3.307 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 29 O UNK 0 24.639 -5.473 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 30 C UNK 0 26.076 -4.920 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 31 C UNK 0 27.274 -5.888 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 32 N UNK 0 28.711 -5.335 0.000 0.00 0.00 N+1 HETATM 33 C UNK 0 30.148 -4.781 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 34 C UNK 0 29.264 -6.772 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 35 C UNK 0 28.158 -3.897 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 36 H UNK 0 18.411 -2.154 0.000 0.00 0.00 H+0 CONECT 1 2 CONECT 2 1 3 CONECT 3 2 4 CONECT 4 3 5 CONECT 5 4 6 CONECT 6 5 7 CONECT 7 6 8 CONECT 8 7 9 CONECT 9 8 10 CONECT 10 9 11 CONECT 11 10 12 CONECT 12 11 13 CONECT 13 12 14 CONECT 14 13 15 CONECT 15 14 16 CONECT 16 15 17 CONECT 17 16 18 CONECT 18 17 19 20 CONECT 19 18 CONECT 20 18 21 CONECT 21 20 22 CONECT 22 21 23 24 36 CONECT 23 22 CONECT 24 22 25 CONECT 25 24 26 CONECT 26 25 27 28 29 CONECT 27 26 CONECT 28 26 CONECT 29 26 30 CONECT 30 29 31 CONECT 31 30 32 CONECT 32 31 33 34 35 CONECT 33 32 CONECT 34 32 CONECT 35 32 CONECT 36 22 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 36 0 70 0 END SMILES for #<Metabolite:0x00007fd5da271598>[H][C@@](O)(COC(=O)CCCCC=CCC=CCC=CCCCCC)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C INCHI for #<Metabolite:0x00007fd5da271598>InChI=1S/C26H48NO7P/c1-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-17-18-19-20-26(29)32-23-25(28)24-34-35(30,31)33-22-21-27(2,3)4/h9-10,12-13,15-16,25,28H,5-8,11,14,17-24H2,1-4H3/t25-/m1/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fd5da271598> | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Formula | C26H48NO7P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Mass | 517.6356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 517.316839407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | (2-{[(2R)-2-hydroxy-3-(octadeca-6,9,12-trienoyloxy)propyl phosphonato]oxy}ethyl)trimethylazanium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | (2-{[(2R)-2-hydroxy-3-(octadeca-6,9,12-trienoyloxy)propyl phosphonato]oxy}ethyl)trimethylazanium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H][C@@](O)(COC(=O)CCCCC=CCC=CCC=CCCCCC)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C26H48NO7P/c1-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-17-18-19-20-26(29)32-23-25(28)24-34-35(30,31)33-22-21-27(2,3)4/h9-10,12-13,15-16,25,28H,5-8,11,14,17-24H2,1-4H3/t25-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | MRTUWVDDQVMUCR-RUZDIDTESA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholines. These are glycerophosphocholines in which the glycerol is esterified with a fatty acid at O-1 position, and linked at position 3 to a phosphocholine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Glycerophosphocholines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Proteins and Enzymes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Human Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Metabolic Reactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Health Effects and Bioactivity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Microbial Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Exposure Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Host Biospecimen and Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB027538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
