Showing metabocard for Aldehydo-D-galacturonate (MMDBc0000321)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2020-10-28 18:35:35 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-31 03:26:46 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | MMDBc0000321 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Aldehydo-D-galacturonate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | MOL for #<Metabolite:0x00007fb7e818dbc8>Mrv1533005151517122D 14 13 0 0 0 0 999 V2000 -1.7861 1.0312 0.0000 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.7861 0.2062 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -2.5006 -0.2062 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.0717 -0.2062 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.0717 -1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.3572 0.2062 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.3572 1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.3572 -0.2062 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.3572 -1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.0717 0.2062 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.0717 1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.7861 -0.2062 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.5006 0.2062 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.7861 -1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2 1 0 0 0 0 2 3 2 0 0 0 0 2 4 1 0 0 0 0 4 5 1 1 0 0 0 4 6 1 0 0 0 0 6 7 1 1 0 0 0 6 8 1 0 0 0 0 8 9 1 6 0 0 0 8 10 1 0 0 0 0 10 11 1 6 0 0 0 10 12 1 0 0 0 0 12 13 1 0 0 0 0 12 14 2 0 0 0 0 M CHG 1 13 -1 M END 3D SDF for #<Metabolite:0x00007fb7e818dbc8>Mrv1533005151517122D 14 13 0 0 0 0 999 V2000 -1.7861 1.0312 0.0000 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.7861 0.2062 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -2.5006 -0.2062 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.0717 -0.2062 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.0717 -1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.3572 0.2062 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.3572 1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.3572 -0.2062 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.3572 -1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.0717 0.2062 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.0717 1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.7861 -0.2062 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.5006 0.2062 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.7861 -1.0312 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2 1 0 0 0 0 2 3 2 0 0 0 0 2 4 1 0 0 0 0 4 5 1 1 0 0 0 4 6 1 0 0 0 0 6 7 1 1 0 0 0 6 8 1 0 0 0 0 8 9 1 6 0 0 0 8 10 1 0 0 0 0 10 11 1 6 0 0 0 10 12 1 0 0 0 0 12 13 1 0 0 0 0 12 14 2 0 0 0 0 M CHG 1 13 -1 M END > <DATABASE_ID> MMDBc0000321 > <DATABASE_NAME> MIME > <SMILES> [H]C(=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C([O-])=O > <INCHI_IDENTIFIER> InChI=1S/C6H10O7/c7-1-2(8)3(9)4(10)5(11)6(12)13/h1-5,8-11H,(H,12,13)/p-1/t2-,3+,4+,5-/m0/s1 > <INCHI_KEY> IAJILQKETJEXLJ-RSJOWCBRSA-M > <FORMULA> C6H9O7 > <MOLECULAR_WEIGHT> 193.132 > <EXACT_MASS> 193.03537621 > <JCHEM_ACCEPTOR_COUNT> 7 > <JCHEM_ATOM_COUNT> 22 > <JCHEM_AVERAGE_POLARIZABILITY> 15.775948848009548 > <JCHEM_BIOAVAILABILITY> 1 > <JCHEM_DONOR_COUNT> 4 > <JCHEM_FORMAL_CHARGE> -1 > <JCHEM_GHOSE_FILTER> 0 > <JCHEM_IUPAC> (2S,3R,4S,5R)-2,3,4,5-tetrahydroxy-6-oxohexanoate > <ALOGPS_LOGP> -1.76 > <JCHEM_LOGP> -3.248086025 > <ALOGPS_LOGS> 0.10 > <JCHEM_MDDR_LIKE_RULE> 0 > <JCHEM_NUMBER_OF_RINGS> 0 > <JCHEM_PHYSIOLOGICAL_CHARGE> -1 > <JCHEM_PKA> 12.262057101736255 > <JCHEM_PKA_STRONGEST_ACIDIC> 3.237887361089809 > <JCHEM_PKA_STRONGEST_BASIC> -3.6897568428527263 > <JCHEM_POLAR_SURFACE_AREA> 138.12 > <JCHEM_REFRACTIVITY> 48.0501 > <JCHEM_ROTATABLE_BOND_COUNT> 5 > <JCHEM_RULE_OF_FIVE> 1 > <ALOGPS_SOLUBILITY> 2.65e+02 g/l > <JCHEM_TRADITIONAL_IUPAC> D-galacturonate > <JCHEM_VEBER_RULE> 0 $$$$ PDB for #<Metabolite:0x00007fb7e818dbc8>HEADER PROTEIN 15-MAY-15 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 15-MAY-15 0 HETATM 1 H UNK 0 -3.334 1.925 0.000 0.00 0.00 H+0 HETATM 2 C UNK 0 -3.334 0.385 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 O UNK 0 -4.668 -0.385 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 4 C UNK 0 -2.001 -0.385 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 5 O UNK 0 -2.001 -1.925 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 6 C UNK 0 -0.667 0.385 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 7 O UNK 0 -0.667 1.925 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 8 C UNK 0 0.667 -0.385 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 9 O UNK 0 0.667 -1.925 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 10 C UNK 0 2.001 0.385 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 11 O UNK 0 2.001 1.925 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 12 C UNK 0 3.334 -0.385 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 13 O UNK 0 4.668 0.385 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 14 O UNK 0 3.334 -1.925 0.000 0.00 0.00 O+0 CONECT 1 2 CONECT 2 1 3 4 CONECT 3 2 CONECT 4 2 5 6 CONECT 5 4 CONECT 6 4 7 8 CONECT 7 6 CONECT 8 6 9 10 CONECT 9 8 CONECT 10 8 11 12 CONECT 11 10 CONECT 12 10 13 14 CONECT 13 12 CONECT 14 12 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 14 0 26 0 END SMILES for #<Metabolite:0x00007fb7e818dbc8>[H]C(=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C([O-])=O INCHI for #<Metabolite:0x00007fb7e818dbc8>InChI=1S/C6H10O7/c7-1-2(8)3(9)4(10)5(11)6(12)13/h1-5,8-11H,(H,12,13)/p-1/t2-,3+,4+,5-/m0/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fb7e818dbc8> | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Formula | C6H9O7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Mass | 193.132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 193.03537621 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2S,3R,4S,5R)-2,3,4,5-tetrahydroxy-6-oxohexanoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | D-galacturonate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H]C(=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C([O-])=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C6H10O7/c7-1-2(8)3(9)4(10)5(11)6(12)13/h1-5,8-11H,(H,12,13)/p-1/t2-,3+,4+,5-/m0/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | IAJILQKETJEXLJ-RSJOWCBRSA-M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as glucuronic acid derivatives. Glucuronic acid derivatives are compounds containing a glucuronic acid moiety (or a derivative), which consists of a glucose moiety with the C6 carbon oxidized to a carboxylic acid. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic oxygen compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Organooxygen compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Glucuronic acid derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 1593918 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 12952 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
|