Showing metabocard for Undecaprenyl-diphospho-N-acetylmuramoyl-(N-acetylglucosamine)-L-alanyl-D-glutaminyl-meso-2,6-diaminopimeloyl-D-alanyl-D-alanine (MMDBc0030109)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-11-17 23:54:15 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-31 17:39:46 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | MMDBc0030109 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Undecaprenyl-diphospho-N-acetylmuramoyl-(N-acetylglucosamine)-L-alanyl-D-glutaminyl-meso-2,6-diaminopimeloyl-D-alanyl-D-alanine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Undecaprenyl-diphospho-n-acetylmuramoyl-(n-acetylglucosamine)-l-alanyl-d-glutaminyl-meso-2,6-diaminopimeloyl-d-alanyl-d-alanine is a peptide. It is a key component of peptidoglycan synthesis. The peptidoglycan synthesis pathway starts at the cytoplasm, where in six steps the peptidoglycan precursor a UDP-N-acetylmuramoyl-pentapeptide is synthesized. This precursor is then attached to the memberane acceptor all-trans-undecaprenyl phosphate, generating a N-acetylmuramoyl-pentapeptide-diphosphoundecaprenol, also known as lipid I. Another transferase then adds UDP-N-acetyl-D-glucosamine, yielding the complete monomeric unit a lipid II, also known as lipid II. This final lipid intermediate is transferred through the membrane. The peptidoglycan monomers are then polymerized on the outside surface by glycosyltransferases, which form the linear glycan chains, and transpeptidases, which catalyze the formation of peptide crosslinks. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Formula | C95H157N9O27P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Mass | 1919.2547 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 1918.066413887 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2S,6R)-2-amino-6-{[(1R)-1-{[(1R)-1-carboxyethyl]-C-hydroxycarbonimidoyl}ethyl]-C-hydroxycarbonimidoyl}-6-{[(2R)-2-{[(2S)-2-[(2-{[(2R,3S,4R,5R)-3-{[(2S,3R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-3-[(1-hydroxyethylidene)amino]-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}-6-{[hydroxy({[hydroxy({[(2E,6E,10E,14E,18E,22E,26E,30E,34E,38E)-3,7,11,15,19,23,27,31,35,39,43-undecamethyltetratetraconta-2,6,10,14,18,22,26,30,34,38,42-undecaen-1-yl]oxy})phosphoryl]oxy})phosphoryl]oxy}-5-[(1-hydroxyethylidene)amino]-2-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-1-hydroxypropylidene)amino]-1-hydroxypropylidene]amino}-1-hydroxy-4-(C-hydroxycarbonimidoyl)butylidene]amino}hexanoic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (2S,6R)-2-amino-6-{[(1R)-1-{[(1R)-1-carboxyethyl]-C-hydroxycarbonimidoyl}ethyl]-C-hydroxycarbonimidoyl}-6-{[(2R)-2-{[(2S)-2-[(2-{[(2R,3S,4R,5R)-3-{[(2S,3R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-3-[(1-hydroxyethylidene)amino]-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}-6-{[hydroxy({hydroxy[(2E,6E,10E,14E,18E,22E,26E,30E,34E,38E)-3,7,11,15,19,23,27,31,35,39,43-undecamethyltetratetraconta-2,6,10,14,18,22,26,30,34,38,42-undecaen-1-yl]oxyphosphoryl}oxy)phosphoryl]oxy}-5-[(1-hydroxyethylidene)amino]-2-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-1-hydroxypropylidene)amino]-1-hydroxypropylidene]amino}-1-hydroxy-4-(C-hydroxycarbonimidoyl)butylidene]amino}hexanoic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | OC[C@@]1([H])O[C@@]([H])(O[C@]2([H])[C@@]([H])(CO)OC([H])(OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CC\C([H])=C(/C)CCC=C(C)C)[C@]([H])(N=C(C)O)[C@@]2([H])OC(C)([H])C(O)=N[C@](C)([H])C(O)=N[C@]([H])(CCC(=N)O)C(O)=N[C@]([H])(CCC[C@@](N)([H])C(=O)O)C(O)=N[C@@](C)([H])C(O)=N[C@@](C)([H])C(=O)O)[C@]([H])(N=C(C)O)[C@](O)([H])[C@@]1(O)[H] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C95H157N9O27P2/c1-58(2)30-19-31-59(3)32-20-33-60(4)34-21-35-61(5)36-22-37-62(6)38-23-39-63(7)40-24-41-64(8)42-25-43-65(9)44-26-45-66(10)46-27-47-67(11)48-28-49-68(12)54-55-125-132(121,122)131-133(123,124)130-95-82(102-74(18)108)86(85(79(57-106)128-95)129-94-81(101-73(17)107)84(111)83(110)78(56-105)127-94)126-72(16)89(114)98-70(14)88(113)103-77(52-53-80(97)109)91(116)104-76(51-29-50-75(96)93(119)120)90(115)99-69(13)87(112)100-71(15)92(117)118/h30,32,34,36,38,40,42,44,46,48,54,69-72,75-79,81-86,94-95,105-106,110-111H,19-29,31,33,35,37,39,41,43,45,47,49-53,55-57,96H2,1-18H3,(H2,97,109)(H,98,114)(H,99,115)(H,100,112)(H,101,107)(H,102,108)(H,103,113)(H,104,116)(H,117,118)(H,119,120)(H,121,122)(H,123,124)/b59-32+,60-34+,61-36+,62-38+,63-40+,64-42+,65-44+,66-46+,67-48+,68-54+/t69-,70+,71-,72?,75+,76-,77-,78-,79-,81-,82-,83-,84-,85-,86-,94+,95?/m1/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | LKSKDJLUCDKSHW-WJEGFZIFSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as polyprenyl phospho carbohydrates. These are polyprenyl phosphates with a carbohydrate moiety attached to it. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Prenol lipids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Polyprenols | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Polyprenyl phospho carbohydrates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations |
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Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 11953874 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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