Showing metabocard for (2Z)-2-aminobut-2-enoate (MMDBc0032127)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-11-18 02:03:31 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-31 18:30:44 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | MMDBc0032127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | (2Z)-2-aminobut-2-enoate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | (2Z)-2-aminobut-2-enoate is an intermediate of pathways L-threonine degradation I and L-isoleucine biosynthesis I in E. coli. It is a product for enzymes threonine dehydratase and threonine deaminase which catalyze the reaction L-threonine -> (2Z)-2-aminobut-2-enoate + H2O + H+ in both pathways. (2Z)-2-aminobut-2-enoate is also a substrate of the spontaneous reaction (2Z)-2-aminobut-2-enoate -> 2-iminobutanoate in both pathways (BioCyc compound: CPD-15056). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | MOL for #<Metabolite:0x00007fd5cc97d278>Mrv1652303072020242D 7 6 0 0 0 0 999 V2000 1.2376 0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.8251 0.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.4125 0.7145 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.4125 -0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 -1.4290 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.2376 -0.7145 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1 1 4 0 0 0 2 3 2 0 0 0 0 3 4 1 0 0 0 0 3 5 1 0 0 0 0 5 6 2 0 0 0 0 5 7 1 0 0 0 0 M CHG 1 7 -1 M END 3D SDF for #<Metabolite:0x00007fd5cc97d278>Mrv1652303072020242D 7 6 0 0 0 0 999 V2000 1.2376 0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.8251 0.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.4125 0.7145 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.4125 -0.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0000 -1.4290 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -1.2376 -0.7145 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1 1 4 0 0 0 2 3 2 0 0 0 0 3 4 1 0 0 0 0 3 5 1 0 0 0 0 5 6 2 0 0 0 0 5 7 1 0 0 0 0 M CHG 1 7 -1 M END > <DATABASE_ID> MMDBc0032127 > <DATABASE_NAME> MIME > <SMILES> CC=C(N)C([O-])=O > <INCHI_IDENTIFIER> InChI=1S/C4H7NO2/c1-2-3(5)4(6)7/h2H,5H2,1H3,(H,6,7)/p-1 > <INCHI_KEY> PAWSVPVNIXFKOS-UHFFFAOYSA-M > <FORMULA> C4H6NO2 > <MOLECULAR_WEIGHT> 100.098 > <EXACT_MASS> 100.040402017 > <JCHEM_ACCEPTOR_COUNT> 3 > <JCHEM_ATOM_COUNT> 13 > <JCHEM_AVERAGE_POLARIZABILITY> 9.330361361317566 > <JCHEM_BIOAVAILABILITY> 1 > <JCHEM_DONOR_COUNT> 1 > <JCHEM_FORMAL_CHARGE> -1 > <JCHEM_GHOSE_FILTER> 0 > <JCHEM_IUPAC> 2-aminobut-2-enoate > <ALOGPS_LOGP> 0.14 > <JCHEM_LOGP> -2.491002868386687 > <ALOGPS_LOGS> 0.45 > <JCHEM_MDDR_LIKE_RULE> 0 > <JCHEM_NUMBER_OF_RINGS> 0 > <JCHEM_PHYSIOLOGICAL_CHARGE> 0 > <JCHEM_PKA_STRONGEST_ACIDIC> 2.8834557368672318 > <JCHEM_PKA_STRONGEST_BASIC> 8.46256977320568 > <JCHEM_POLAR_SURFACE_AREA> 66.15 > <JCHEM_REFRACTIVITY> 37.4269 > <JCHEM_ROTATABLE_BOND_COUNT> 1 > <JCHEM_RULE_OF_FIVE> 1 > <ALOGPS_SOLUBILITY> 3.31e+02 g/l > <JCHEM_TRADITIONAL_IUPAC> 2-aminobut-2-enoate > <JCHEM_VEBER_RULE> 0 $$$$ PDB for #<Metabolite:0x00007fd5cc97d278>HEADER PROTEIN 07-MAR-20 NONE TITLE NULL COMPND NULL SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 07-MAR-20 0 HETATM 1 C UNK 0 2.310 1.334 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 2 C UNK 0 1.540 0.000 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 3 C UNK 0 0.000 0.000 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 4 N UNK 0 -0.770 1.334 0.000 0.00 0.00 N+0 HETATM 5 C UNK 0 -0.770 -1.334 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 6 O UNK 0 0.000 -2.667 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 7 O UNK 0 -2.310 -1.334 0.000 0.00 0.00 O-1 CONECT 1 2 CONECT 2 1 3 CONECT 3 2 4 5 CONECT 4 3 CONECT 5 3 6 7 CONECT 6 5 CONECT 7 5 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 12 0 END INCHI for #<Metabolite:0x00007fd5cc97d278>InChI=1S/C4H7NO2/c1-2-3(5)4(6)7/h2H,5H2,1H3,(H,6,7)/p-1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fd5cc97d278> | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Formula | C4H6NO2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Mass | 100.098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 100.040402017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | 2-aminobut-2-enoate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | 2-aminobut-2-enoate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CC=C(N)C([O-])=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C4H7NO2/c1-2-3(5)4(6)7/h2H,5H2,1H3,(H,6,7)/p-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | PAWSVPVNIXFKOS-UHFFFAOYSA-M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as alpha amino acids. These are amino acids in which the amino group is attached to the carbon atom immediately adjacent to the carboxylate group (alpha carbon). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Carboxylic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Amino acids, peptides, and analogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Alpha amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolic Reactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Health Effects and Bioactivity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Microbial Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Exposure Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Host Biospecimen and Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 75104761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 58739 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
|