Showing metabocard for β-D-glucose 1-phosphate (MMDBc0032159)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-11-18 02:04:50 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-31 18:30:59 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | MMDBc0032159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | β-D-glucose 1-phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Beta-D-glucose 1-phosphate is a member of the chemical class known as Hexoses. These are monosaccharides in which the sugar unit is a hexose. Trehalose phosphorylase from Thermoanaerobacter sp. is a glycoside hydrolase family 65 enzyme which catalyzes the reversible breakdown of trehalose [D-glucopyranosyl-alpha(1,1)alpha-D-glucopyranose] to beta-D-glucose 1-phosphate and D-glucose. (PMID 20383018 ) SgrS is an Hfq-binding small RNA that is induced under glucose phosphate stress in Escherichia coli. (PMID 18650387 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | MOL for #<Metabolite:0x00007fd5cc0db570>Mrv1533006101514072D 15 15 0 0 1 0 999 V2000 23.3505 -14.6165 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23.3505 -16.2665 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.2084 -16.2665 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.7795 -17.0915 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.7795 -14.6165 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.2084 -14.6165 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.0650 -15.0290 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25.4940 -15.0290 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.0650 -15.8540 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25.4940 -15.8540 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.7795 -16.2665 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.9228 -15.0289 0.0000 P 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.9228 -15.8539 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.9258 -14.2258 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27.6652 -15.0368 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 1 1 1 0 0 0 9 2 1 1 0 0 0 10 3 1 1 0 0 0 11 4 1 6 0 0 0 5 7 1 0 0 0 0 5 8 1 0 0 0 0 7 9 1 0 0 0 0 8 10 1 0 0 0 0 9 11 1 0 0 0 0 10 11 1 0 0 0 0 12 14 1 0 0 0 0 12 13 2 0 0 0 0 12 15 1 0 0 0 0 8 6 1 6 0 0 0 6 12 1 0 0 0 0 M CHG 2 14 -1 15 -1 M END 3D SDF for #<Metabolite:0x00007fd5cc0db570>Mrv1533006101514072D 15 15 0 0 1 0 999 V2000 23.3505 -14.6165 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23.3505 -16.2665 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.2084 -16.2665 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.7795 -17.0915 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.7795 -14.6165 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.2084 -14.6165 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.0650 -15.0290 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25.4940 -15.0290 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.0650 -15.8540 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25.4940 -15.8540 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24.7795 -16.2665 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.9228 -15.0289 0.0000 P 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.9228 -15.8539 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26.9258 -14.2258 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27.6652 -15.0368 0.0000 O 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 1 1 1 0 0 0 9 2 1 1 0 0 0 10 3 1 1 0 0 0 11 4 1 6 0 0 0 5 7 1 0 0 0 0 5 8 1 0 0 0 0 7 9 1 0 0 0 0 8 10 1 0 0 0 0 9 11 1 0 0 0 0 10 11 1 0 0 0 0 12 14 1 0 0 0 0 12 13 2 0 0 0 0 12 15 1 0 0 0 0 8 6 1 6 0 0 0 6 12 1 0 0 0 0 M CHG 2 14 -1 15 -1 M END > <DATABASE_ID> MMDBc0032159 > <DATABASE_NAME> MIME > <SMILES> O[C@H]1O[C@H](OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O > <INCHI_IDENTIFIER> InChI=1S/C5H11O9P/c6-1-2(7)4(9)13-5(3(1)8)14-15(10,11)12/h1-9H,(H2,10,11,12)/p-2/t1-,2-,3+,4+,5-/m1/s1 > <INCHI_KEY> VPFDELVVUOEHIT-OGZQUKKDSA-L > <FORMULA> C5H9O9P > <MOLECULAR_WEIGHT> 244.093 > <EXACT_MASS> 243.999516028 > <JCHEM_ACCEPTOR_COUNT> 8 > <JCHEM_ATOM_COUNT> 24 > <JCHEM_AVERAGE_POLARIZABILITY> 18.06125306674756 > <JCHEM_BIOAVAILABILITY> 1 > <JCHEM_DONOR_COUNT> 4 > <JCHEM_FORMAL_CHARGE> -2 > <JCHEM_GHOSE_FILTER> 0 > <JCHEM_IUPAC> (2R,3S,4R,5R,6S)-3,4,5,6-tetrahydroxyoxan-2-yl phosphate > <ALOGPS_LOGP> -1.82 > <JCHEM_LOGP> -2.7899942490000003 > <ALOGPS_LOGS> -0.45 > <JCHEM_MDDR_LIKE_RULE> 0 > <JCHEM_NUMBER_OF_RINGS> 1 > <JCHEM_PHYSIOLOGICAL_CHARGE> -2 > <JCHEM_PKA> 6.210795537073449 > <JCHEM_PKA_STRONGEST_ACIDIC> 1.1474188528484168 > <JCHEM_PKA_STRONGEST_BASIC> -3.7121029944501016 > <JCHEM_POLAR_SURFACE_AREA> 162.57000000000002 > <JCHEM_REFRACTIVITY> 39.6203 > <JCHEM_ROTATABLE_BOND_COUNT> 2 > <JCHEM_RULE_OF_FIVE> 1 > <ALOGPS_SOLUBILITY> 1.00e+02 g/l > <JCHEM_TRADITIONAL_IUPAC> (2R,3S,4R,5R,6S)-3,4,5,6-tetrahydroxyoxan-2-yl phosphate > <JCHEM_VEBER_RULE> 0 $$$$ PDB for #<Metabolite:0x00007fd5cc0db570>HEADER PROTEIN 10-JUN-15 NONE TITLE NULL COMPND MOLECULE: SOURCE NULL KEYWDS NULL EXPDTA NULL AUTHOR Marvin REVDAT 1 10-JUN-15 0 HETATM 1 O UNK 0 43.588 -27.284 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 2 O UNK 0 43.588 -30.364 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 3 O UNK 0 48.922 -30.364 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 4 O UNK 0 46.255 -31.904 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 5 O UNK 0 46.255 -27.284 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 6 O UNK 0 48.922 -27.284 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 7 C UNK 0 44.921 -28.054 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 8 C UNK 0 47.589 -28.054 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 9 C UNK 0 44.921 -29.594 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 10 C UNK 0 47.589 -29.594 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 11 C UNK 0 46.255 -30.364 0.000 0.00 0.00 C+0 HETATM 12 P UNK 0 50.256 -28.054 0.000 0.00 0.00 P+0 HETATM 13 O UNK 0 50.256 -29.594 0.000 0.00 0.00 O+0 HETATM 14 O UNK 0 50.261 -26.555 0.000 0.00 0.00 O-1 HETATM 15 O UNK 0 51.642 -28.069 0.000 0.00 0.00 O-1 CONECT 1 7 CONECT 2 9 CONECT 3 10 CONECT 4 11 CONECT 5 7 8 CONECT 6 8 12 CONECT 7 1 5 9 CONECT 8 5 10 6 CONECT 9 2 7 11 CONECT 10 3 8 11 CONECT 11 4 9 10 CONECT 12 14 13 15 6 CONECT 13 12 CONECT 14 12 CONECT 15 12 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 30 0 END SMILES for #<Metabolite:0x00007fd5cc0db570>O[C@H]1O[C@H](OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O INCHI for #<Metabolite:0x00007fd5cc0db570>InChI=1S/C5H11O9P/c6-1-2(7)4(9)13-5(3(1)8)14-15(10,11)12/h1-9H,(H2,10,11,12)/p-2/t1-,2-,3+,4+,5-/m1/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fd5cc0db570> | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Molecular Formula | C5H9O9P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Mass | 244.093 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 243.999516028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2R,3S,4R,5R,6S)-3,4,5,6-tetrahydroxyoxan-2-yl phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | (2R,3S,4R,5R,6S)-3,4,5,6-tetrahydroxyoxan-2-yl phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | O[C@H]1O[C@H](OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C5H11O9P/c6-1-2(7)4(9)13-5(3(1)8)14-15(10,11)12/h1-9H,(H2,10,11,12)/p-2/t1-,2-,3+,4+,5-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | VPFDELVVUOEHIT-OGZQUKKDSA-L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as monosaccharides. Monosaccharides are compounds containing one carbohydrate unit not glycosidically linked to another such unit, and no set of two or more glycosidically linked carbohydrate units. Monosaccharides have the general formula CnH2nOn. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Monosaccharides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Human Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Metabolic Reactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Health Effects and Bioactivity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Microbial Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Exposure Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Host Biospecimen and Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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