Showing metabocard for dTDP-thomosamine (MMDBc0032177)
Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-11-18 02:05:39 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-31 18:31:20 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | MMDBc0032177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | dTDP-thomosamine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | dTDP-thomosamine is an intermediate in dTDP-N-acetylthomosamine biosynthesis in E.coli. It is a substrate for the enzyme dTDP-fucosamine acetyltransferase which catalyzes the reaction dTDP-thomosamine + acetyl-CoA -> dTDP-N-acetylthomosamine + coenzyme A + H+. It is also a product for enzyme dTDP-4-dehydro-6-deoxy-D-glucose transaminase which catalyzes reaction dTDP-4-dehydro-6-deoxy-α-D-glucopyranose + L-glutamate -> dTDP-thomosamine + 2-oxoglutarate (BioCyc compound: TDP-D-FUCOSAMINE). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | MOL for #<Metabolite:0x00007fd5f9a26418>Mrv1533006301518552D 43 45 0 0 0 0 999 V2000 2.8723 -4.4682 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -3.2870 4.4682 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.8285 -0.8413 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.7229 -3.0470 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.7090 -0.5864 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.2078 -3.7145 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -3.1155 3.6612 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.1610 -0.3564 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.4936 -0.8413 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.5735 -1.6259 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -3.7286 3.1091 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -3.5571 2.3022 0.0000 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -2.7725 2.0472 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4.0283 -3.6282 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -2.1594 2.5993 0.0000 C 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.8789 -2.2071 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -4.5132 3.3641 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4.3639 -2.8746 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.0585 -2.2934 0.0000 N 0 0 0 0 0 0 0 0 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31 38 CONECT 10 3 19 31 39 CONECT 11 7 12 17 40 CONECT 12 11 13 21 41 CONECT 13 12 15 22 42 CONECT 14 6 18 23 CONECT 15 13 30 32 43 CONECT 16 18 19 24 CONECT 17 11 CONECT 18 14 16 CONECT 19 4 10 16 CONECT 20 8 CONECT 21 12 CONECT 22 13 CONECT 23 14 CONECT 24 16 CONECT 25 34 CONECT 26 34 CONECT 27 35 CONECT 28 35 CONECT 29 5 34 CONECT 30 7 15 CONECT 31 9 10 CONECT 32 15 35 CONECT 33 34 35 CONECT 34 25 26 29 33 CONECT 35 27 28 32 33 CONECT 36 7 CONECT 37 8 CONECT 38 9 CONECT 39 10 CONECT 40 11 CONECT 41 12 CONECT 42 13 CONECT 43 15 MASTER 0 0 0 0 0 0 0 0 43 0 90 0 END SMILES for #<Metabolite:0x00007fd5f9a26418>[H][C@]1(O)C[C@@]([H])(O[C@]1([H])COP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@@]1([H])O[C@]([H])(C)[C@]([H])(N)[C@]([H])(O)[C@@]1([H])O)N1C=C(C)C([O-])=NC1=O INCHI for #<Metabolite:0x00007fd5f9a26418>InChI=1S/C16H27N3O14P2/c1-6-4-19(16(24)18-14(6)23)10-3-8(20)9(31-10)5-29-34(25,26)33-35(27,28)32-15-13(22)12(21)11(17)7(2)30-15/h4,7-13,15,20-22H,3,5,17H2,1-2H3,(H,25,26)(H,27,28)(H,18,23,24)/p-1/t7-,8+,9-,10-,11+,12+,13-,15-/m1/s1 3D Structure for #<Metabolite:0x00007fd5f9a26418> | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Molecular Formula | C16H26N3O14P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Mass | 546.339 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 546.089550105 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | 1-[(2R,4S,5R)-5-[({[({[(2R,3R,4S,5R,6R)-5-amino-3,4-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl)oxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-olate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | 1-[(2R,4S,5R)-5-{[({[(2R,3R,4S,5R,6R)-5-amino-3,4-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy(hydroxy)phosphoryl}oxy(hydroxy)phosphoryl)oxy]methyl}-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methyl-2-oxopyrimidin-4-olate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@]1(O)C[C@@]([H])(O[C@]1([H])COP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@@]1([H])O[C@]([H])(C)[C@]([H])(N)[C@]([H])(O)[C@@]1([H])O)N1C=C(C)C([O-])=NC1=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C16H27N3O14P2/c1-6-4-19(16(24)18-14(6)23)10-3-8(20)9(31-10)5-29-34(25,26)33-35(27,28)32-15-13(22)12(21)11(17)7(2)30-15/h4,7-13,15,20-22H,3,5,17H2,1-2H3,(H,25,26)(H,27,28)(H,18,23,24)/p-1/t7-,8+,9-,10-,11+,12+,13-,15-/m1/s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | UIVJXHWSIFBBCY-FQLHZTMTSA-M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as polyprenyl phospho carbohydrates. These are polyprenyl phosphates with a carbohydrate moiety attached to it. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Prenol lipids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Polyprenols | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Polyprenyl phospho carbohydrates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | TDP-D-FUCOSAMINE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 70678920 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 68492 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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